Корреляция между конформационной гибкостью белковых молекул

Корреляция между конформационной гибкостью белковых молекул и температурой среды обусловлена тем, что при работе белковых молекул их конформации меняется и температура влияет на конформационную подвижность. Однако эти положения в полной мере применимы и к нуклеиновым кислотам. Следовательно, и в эволюции нуклеиновых кислот должна соблюдаться корреляция между их конформационной гибкостью и температурной экологией вида, хотя они и сработаны гораздо прочнее белков. Данные в пользу этого довольно подробно рассмотрены в предыдущей монографии (Александров, 1975), здесь приведены будут некоторые дополнительные аргументы.

Как и у белков, все виды биохимической деятельности ДНК и РНК связаны с изменением их конформации, которая поддерживается слабыми связИми и взаимодействиями - водородными связями, гидрофобными, электростатическими и дисперсионными взаимодействиями. В бистшральных структурах к слабым связям относятся Н-связи между нуклеотидами. Их две между аденином (А) и тимином (Т) в ДНК и между аденином и урацилом (У) в РНК, и три между гуанином (Г) и цитозином (Ц) в ДНК и РНК. Поэтому связь Г=Ц прочнее связи А = Т или А = У. Кроме того, биспиральные структуры крепятся взаимодействиями между параллельно расположенными азотистыми основаниями - это так называемые стэкинг-взаимодействия. Они сильнее между пуриновыми основаниями (А, Г), чем между пиримидино-выми (Ц, Т, У). На стабильность нуклеиновых кислот очень влияет ионная сила раствора, присутствие ионов двухвалентных металлов и поликатионов. Большую часть времени нуклеиновые кислоты существуют в комплексе с белками в виде нуклеопротеидов. Белки, находясь в комплексе с нуклеиновыми кислотами, оказывают на них сильное стабилизирующее воздействие.